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Plot:
Die Enterprise begegnet immer mehr Raumanomalien die auf dem Schiff für Verwirrung und Schäden sorgen - unter anderem fällt auch der Warpantrieb aus. Da begegnet man einem Schiff das halb zerstört im Weltraum treibt. Nach einer Untersuchung des Vorfalles stellt man fest dass es angegriffen worden ist - als plötzlich das verantwortliche Schiff auftaucht.

Ein Stosstrupp beamt auf die Enterprise und stiehlt in einer Blitzaktion Vorräte, doch einer der Piraten wird von Trip KO geschlagen.

Als man den Angreifern, die inzwischen als Ossarianer bekannt sind, folgt, trifft man auf ein Tarnfeld die eine Sphäre gigantischen Ausmaßes verdeckt, das den Piraten als Lager dient. Dort findet Maywheather auch eine Datenbank, die darauf hinweist das die Piraten auch ein Xindi Schiff angegriffen haben. Archer gelingt es mit rüden Methoden den Gefangen Ossarianer dazu zu bewegen ihm zu helfen, die Daten die seine Leute über die Xindi gesammelt haben, auf die Enterprise downzuloaden. Nach einem Kampf mit dem Piratenschiff, setzt die Enterprise mit der Datenbank die Suche nach den Xindi fort.
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Plot:
Sechs Wochen nachdem sie in die Delphic Expanse eingedrungen sind, bekommt die Enterprise eine Nachricht von einer Minenkolonie, in der ein Xindi arbeiten soll. Sie wollen ihn um die Koordinaten für die Heimatwelt seiner Rasse bitten. Währenddessen berät sich der Rat der Xindi, wie man mit der Enterprise am besten vorgehen sollte.

Der Besuch von Archer und Trip, erweist sich als Falle vom Besitzer der Mine, der unbedingt neue Sklavenarbeiter gewinnen will. Doch dem neue Team der Elitesoldaten, das seit dem Aufbruch von der Erde mit an Bord ist, gelingt es sie zu befreien. Der Xindi stirbt jedoch bei der Rettungsaktion, kann ihnen aber noch Koordinaten liefern, die allerdings in einem Asteroidenfeld enden.

Tucker hat immer noch Probleme den Tod seiner Schwester zu überwinden, und schläft daher sehr schlecht. Phlox schlägt daher T’Pol vor, Trip eine vulkanische Technik, die beim Einschlafen helfen soll, zukommen zu lassen.
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Plot:
Als Trip eine neue Methode zur Verbesserung des Warpantriebes probiert, gibt es einen Unfall und er wird schwer verletzt. Doktor Phlox kann ihn stabilisieren, aber nicht vollständig heilen. Er schlägt Archer vor einen Klon zu züchten, der Trip mit den notwendigen Hirnteilen versorgen kann, gleichzeitig aber selbst überlebt, wenn auch nur für ein paar Tage, da der Klon nur 2 Wochen zu leben hat.

Archer befürwortet es, und der Klon wird geboren und wächst rapide. Sim, so heißt der Klon nun, erinnert sich aber bald an Dinge aus Trips Leben und je älter er wird umso mehr Dinge sind es, an die er sich erinnert. Er stellt fest dass er nur einige Tage zu leben hat, und je näher er der Operation kommt, umso weniger will er daran teilnehmen, vor allem dann nicht als er erfährt das der Eingriff für ihn tödlich ist. Sim will zuerst fliehen, bricht aber seinen Fluchtversuch ab, und lässt sich operieren. Der richtige Trip wird durch die Operation geheilt, während Sim stirbt und in einer Begräbniszeremonie verabschiedet wird.
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Plot:
Archer, T'pol und Trip landen auf einem Planeten der eine menschliche Zivilisation beherbergt, die noch im Zeitalter des Wilden Westens steckt. Nebenher existiert noch eine weitere Rasse, die Skagaraner, die ein Sklavendasein fristen muss. In der Vergangenheit entführten die Skagaraner die Menschen, um sie als Sklaven zu missbrauchen, doch die Menschen führten einen Aufstand, und raubten ihren Entführern ihre Rechte.

Archer freundet sich mit Bethany, einer Lehrerin an, die junge Skagaraner verbotenerweise unterrichtet. Als sie deswegen gefangen genommen wird, verhilft ihr Archer zur Flucht, doch sie wird angeschossen. Im letzten Moment kann er sie und sich hochbeamen, damit löst er allerdings Furcht unter den Menschen aus, die glauben dass die Skagaraner zurückgekehrt sind.

Archer beschließt mit einem Shuttle wieder zurückzufliegen, und sie darüber aufzuklären dass er von der Erde stammt, und dass sie eines Tages wieder zurückkehren könnten. Just in dem Augenblick tauchen einige Cowboys auf, die Archer und sein Landeteam für Agenten der Skagaraner halten und fangen ein Feuergefecht an, das sie aufgrund des Technologieunterschiedes verlieren.

Man hinterlässt den Menschen dieses Planeten, neben den Versprechen eines Tages zurückzukehren, die geschichtliche Datenbank der Erde der letzten 300 Jahre, und setzt die Suche nach den Xindi fort.
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Plot:
Eine Anomalie trifft das Schiff. Archer kann T'pol gerade noch aus dem Weg ziehen und wird selber von der Anomalie getroffen. Dabei wird er von Parasiten befallen, die ihm das Langzeitgedächtnis rauben. Er ist nur noch in der Lage sich an Dinge vor seinem Unfall zu erinnern, auch sein Kurzzeitgedächtnis ist nicht betroffen. T'Pol muss daraufhin das Kommando über die Xindi Mission übernehmen.

12 Jahre später: Archer erwacht und erfährt das die Erde von den Xindi zerstört worden, und die Menschheit so gut wie ausgerottet ist. Die Enterprise ist eines der letzten Schiffe, die die Kolonie der Überlebenden bewachen.

Als Phlox eine neue Behandlung versucht, stellt man fest, dass die Parasiten zeitrückwirkend zerstört werden, d.h. das sie praktisch nie existieren werden. Damit eröffnet sich die Möglichkeit die Zeitlinie zu verändern. Da wird die Enterprise angegriffen, doch gerade noch vor der Zerstörung gelingt es die Behandlung abzuschließen. Die Zeitlinie wird verändert und Archer wurde nie von den Parasiten befallen.
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